MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-4

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000950	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000950	A	6	6	1315	1320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000950	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000950	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000950	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_000950	TGA	2	6	1463	1468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000950	AG	3	6	1663	1668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000950	GA	3	6	1742	1747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000950	AAC	2	6	1754	1759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_000950	ATTAA	2	10	1783	1792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000950	TTC	3	9	1812	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_000950	TTG	2	6	1844	1849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000950	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000950	GA	3	6	1861	1866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000950	GGA	2	6	3961	3966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000950	AGG	2	6	8268	8273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000950	T	6	6	15095	15100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000950	AT	3	6	15120	15125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000950	TA	3	6	15130	15135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000950	A	6	6	15141	15146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000950	ATA	2	6	16471	16476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000950	CTA	2	6	16998	17003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_000950	ATA	2	6	17029	17034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000950	TAA	2	6	17058	17063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000950	TAA	3	9	17080	17088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000950	A	7	7	17087	17093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000950	TA	3	6	17526	17531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000950	G	6	6	17546	17551	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000950	TCC	2	6	18589	18594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_000950	TAA	2	6	18603	18608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000950	TA	3	6	18614	18619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000950	T	6	6	18641	18646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000950	A	6	6	18649	18654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000950	AAG	2	6	18665	18670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000950	AGGT	2	8	18744	18751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000950	TAAT	2	8	18847	18854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000950	TAA	2	6	18860	18865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000950	T	7	7	18879	18885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000950	TAA	2	6	18936	18941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000950	AAAT	2	8	21387	21394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000950	AGG	2	6	21404	21409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000950	AAC	2	6	22125	22130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_000950	TAAT	2	8	22134	22141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000950	ATAG	2	8	22166	22173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000950	ATAG	2	8	22187	22194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000950	A	6	6	22200	22205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000950	AT	3	6	22218	22223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000950	A	7	7	22251	22257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000950	GCAA	2	8	22268	22275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_000950	TAA	2	6	22296	22301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000950	TCTAT	2	10	22326	22335	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_000950	TAA	2	6	22339	22344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000950	T	6	6	22348	22353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000950	TAA	2	6	22383	22388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000950	TA	3	6	22394	22399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000950	T	6	6	22424	22429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000950	TTTTA	2	10	22453	22462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000950	AAT	2	6	22473	22478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000950	TAAGC	2	10	22534	22543	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_000950	TTA	2	6	22552	22557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000950	TAA	2	6	22578	22583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000950	TATT	2	8	22590	22597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000950	ATA	2	6	22598	22603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000950	ATATGT	2	12	22644	22655	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000950	A	7	7	22662	22668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000950	A	7	7	22681	22687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000950	T	6	6	22748	22753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000950	T	6	6	22760	22765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000950	A	6	6	22768	22773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000950	TA	3	6	22795	22800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000950	ATT	2	6	22801	22806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000950	AGG	2	6	22819	22824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000950	A	6	6	24168	24173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000950	A	8	8	24176	24183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000950	AGG	2	6	24196	24201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000950	ATTA	2	8	24202	24209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000950	AAGTAA	2	12	25470	25481	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000950	TGCA	2	8	25556	25563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_000950	AGA	2	6	25595	25600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000950	GGT	2	6	25614	25619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000950	AAGA	2	8	25624	25631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000950	AT	3	6	25648	25653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000950	AATTT	2	10	25668	25677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000950	AGT	2	6	25705	25710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000950	GA	3	6	25723	25728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000950	TA	3	6	25794	25799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000950	ATT	2	6	25822	25827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000950	TGT	2	6	25831	25836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000950	ATT	2	6	25889	25894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000950	TTTTG	2	10	25903	25912	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000950	ATA	2	6	25929	25934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000950	CTTTAT	2	12	25935	25946	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_000950	ATG	2	6	25947	25952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000950	AAT	2	6	25984	25989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000950	ACA	2	6	26832	26837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_000950	TTTA	2	8	27649	27656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000950	TA	3	6	27655	27660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000950	CT	3	6	27661	27666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_000950	TAA	2	6	28222	28227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000950	AATA	2	8	28263	28270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000950	ATA	2	6	28300	28305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000950	GTTAAT	2	12	28306	28317	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000950	TAA	2	6	28321	28326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000950	TAA	2	6	28346	28351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000950	GTT	2	6	28352	28357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.